مقدار فراوان فیبر در سیب، می‌تواند به تمیز کردن دستگاه گوارش کمک کند، و از بوجود آمدن مشکلاتی همچون اسهال و یبوست جلوگیری نماید. این خاصیت همچنین می‌تواند از بوجود آمدن سنگ صفرا نیز پیشگیری کند. فیبر دو کار مجزا می‌کند، هم مایع زیادی را از روده‌ی بزرگ، یعنی همان راهی که غذای هضم شده در آن حرکت می‌کند، پاک می‌کند و هم آب غیر ضروری را از مدفوع جذب می‌نماید.
