راستش در مورد دستگاههای تصفیه آب حرفهای زیاد و گوناگونی زده شده، که اگر بخواهیم از مفید بودن این دستگاهها در جهت تصفیه مواد مضر آب مثل نیترات فاکتور بگیریم، مضرات مختلفی هم برای آن شمرده شده، ازجمله:یکی از مشکلات استفاده از آبهای تصفیه شده را پوکی استخوان در دراز مدت عنوان میکنند و آنهم بدلیل حذف املاح مفید آب هست. به طور کل در تمامی دستگاه هائی که دارای فیلتر و محفظه بسته هستند به علت وجود رطوبت در آنها و کمبود اکسیژن و نور در آنها باکتری های خطرناک سریعا رشد کرده و به محض استفاده مجدد، آنها وارد آب شده و می توانند باعث بیماری شوند.
از سوی دیگر این دستگاه ها تمامی املاح آب را گرفته و آب مقطر تولید می کنند.هر چند که فروشندگان این دستگاه ها در مصرف آب مقطر اشکالی نمی بینند اما بر اساس نظر بسیاری از پزشکان و هم چنین انجمن تغذیه آلمان ) Deutsche Gesellschaft für Ernaehrung (DGE)) مصرف این آب می تواند در مواردی حتی به اختلالات جدی در بدن انسان منجر شود.
